工程款项支付与结算的具体流程通常涉及多个环节，以下是一个概括性的描述：

　　一、预付款支付

　　在工程项目启动前，发包方(业主)通常会根据合同约定向承包方(施工单位)支付一笔预付款。这笔款项通常用于项目启动前的准备工作，如材料采购、设备租赁、人员培训等。预付款的支付比例和条件会根据合同的具体条款而有所不同。

　　二、进度款支付

　　随着工程项目的进展，承包方会按照合同约定的工程进度向发包方提交进度款申请。进度款申请通常包括已完成的工作量、质量验收报告、相关证明材料等。发包方在收到申请后，会进行核实和审批，然后根据合同约定的支付比例向承包方支付进度款。

　　三、结算款支付

　　当工程项目全部或部分完成后，承包方会向发包方提交结算申请。结算申请通常包括工程竣工报告、质量验收合格证明、工程变更签证、索赔资料等。发包方在收到申请后，会组织相关部门进行验收和审计，确认工程质量和工程量是否符合合同约定。一旦验收和审计通过，发包方会根据合同约定的结算方式和支付比例向承包方支付结算款。

　　四、质保金退还

　　在工程项目竣工验收合格后，通常会扣留一部分款项作为质保金。质保金的扣留比例和退还条件会根据合同的具体条款而有所不同。在质保期内，若工程未出现质量问题或承包方已按照合同约定履行了保修义务，发包方会在质保期满后向承包方退还质保金。

　　五、争议解决与支付调整

　　在工程项目进展过程中，若双方对工程量、工程质量、支付比例等方面存在争议，应及时进行沟通协商。若协商不成，可按照合同约定的争议解决方式(如调解、仲裁或诉讼)进行处理。在处理过程中，双方应根据裁决结果对支付款项进行相应的调整。

　　六、记录与归档

　　在整个支付与结算流程中，双方应妥善保管相关文件和资料，如合同、进度款申请、结算申请、验收报告、审计报告等。这些文件和资料是后续争议解决和支付调整的重要依据。同时，双方还应建立完善的记录与归档制度，以便随时查阅和追溯。